Al otro lado de la Red hay un mundo sin fin: el Mundo Digital y Digimon viven ahí. Una falla en la Red a gran escala estalló en el corazón del área metropolitana de Tokio. Hubo una visión del semáforo parpadeando aleatoriamente y un texto confuso. La noticia fue reportada como Ciberterrorismo.
El protagonista es Taichi Yagami de quinto grado, que vive en un edificio de departamentos a las afueras de Tokio. Se quedó solo en casa para prepararse para un campamento de verano durante el fin de semana, pero su madre y su hermana menor Hikari que fueron a Shibuya están en un tren que no puede detenerse.
Taichi corre a Shibuya para rescatar a su madre y su hermana, pero en el momento que se dirigia a la plataforma… ¡Un misterioso fenómeno ocurrió y Taichi entró en el Mundo Digital!.
Los niños conocieron a sus Digimon Compañeros y se enfrentan a una “Aventura” desconocida…!