En el año 2020, una nación enfrenta la amenaza generalizada de los “Otros”, monstruos misteriosos que caen del cielo y se alimentan de cerebros humanos. Al mismo tiempo, se descubre en el cuerpo humano la psiónica, una hormona que otorga a ciertas personas habilidades extrasensoriales que son efectivas contra los Otros. Posteriormente, el fundador de la nación establece la Otra Fuerza de Supresión (OSF) para combatir a estos monstruos y salvar a la humanidad. Comúnmente conocidos como los Guardianes Escarlata, los jóvenes con psiónica se someten a un entrenamiento intensivo para unirse a este grupo.
Un día, la nación prepara una ceremonia de inducción para los excepcionales reclutas que completaron el agotador entrenamiento para convertirse en Guardianes Escarlata. Entre estas jóvenes élites se encuentra Yuito Sumeragi, el decidido hijo del fundador de la nación; a la edad de cinco años, fue rescatado por una mujer en el OSF. Para pagar esta deuda, se une a la organización, deseoso de hacer un buen uso de su formación. Cuando conoce a sus nuevos camaradas, se enfrenta a un gran problema: la mujer que lo salvó hace años se parece mucho a uno de sus compañeros de equipo. Sin embargo, esta debería ser la menor de sus preocupaciones: sin que él lo sepa, se está gestando una conspiración, una con la capacidad de sacudir a todo el país.